确定旅游专列奖金的合适数额需要综合考虑多个因素，包括旅游目的地的吸引力、专列的规模、组织难度以及预期的社会和经济效益。以下是一些关键点和建议：

旅游目的地吸引力：

如果目的地是热门旅游城市或景区，如大同、运城、三门峡等，奖金数额可以相应提高，以吸引更多旅行社组织专列。

专列规模：

规模较大的专列（如400人以上）通常可以获得更高的奖金，因为它们带来的游客数量更多，对目的地的经济贡献也更大。

组织难度：

组织难度较高的专列（如需要特别安排住宿、游览多个景点等）也可以获得更高的奖金，以补偿组织者的额外努力和成本。

预期效益：

奖金数额应能够反映专列对当地旅游业的实际贡献，如促进当地经济发展、增加就业机会等。

市场竞争：

考虑到市场上可能存在多个竞争者，奖金数额应具有竞争力，以激励旅行社积极参与。

政策连贯性：

奖金数额应与现有的旅游奖励政策保持一致，以便于旅行社理解和遵守。

可持续性：

奖金数额应考虑到财政的可持续性，避免因奖金过高而导致财政压力。

综合以上因素，以下是一些具体的建议：

对于一次性组织400人以上乘专列入内蒙古的旅游专列，每列给予一次性奖励5万元。

对于一次性组织300人以上乘专列入内蒙古的旅游专列，每列给予一次性奖励1.5万元。

对于一次性组织400人以上旅游专列（旅游专列须在大同站或大同南站停靠），住宿1晚以上、游览2个4A级以上收费景区，购票率达到50%以上的，按完成时间顺序，对组织前3个车次的机构分别给予10万元奖励。

对于一次性组织200人以上乘高铁来大同旅游的，视为旅游专列（奖励条件同上），按完成时间顺序，对组织前3车次的机构分别给予5万元奖励。

根据以上信息，可以认为旅游专列的奖金数额应根据具体情况进行调整，以确保奖励政策既能激励旅行社组织专列，又能促进旅游目的地的经济发展。