《青春有你3》被停播的原因主要包括以下几点：

选手余景天的丑闻：

余景天因其家庭背景和个人行为引发了大量争议，包括其父母旗下的KTV涉嫌违法经营、拥有双重国籍的传闻以及早期发表的不当言论等。这些丑闻严重影响了节目的形象和声誉。

粉丝倒奶事件：

节目中的投票环节需要粉丝购买赞助商的牛奶并扫描瓶盖内的二维码进行投票，导致大量牛奶被浪费并倒掉。这种行为违反了食品浪费法，引起了官方媒体的严厉批评，并最终导致节目被叫停。

节目制作方的违规行为：

节目制作方在选拔过程中出现了严重的舞弊现象，包括选手通过不正当手段获取高分，甚至存在买票的情况。这种行为破坏了比赛的公平性，损害了观众的利益。

北京广播电视局的责令：

由于上述问题，北京广播电视局责令爱奇艺停止录制《青春有你3》，并要求节目制作方进行核查和整改。

综上所述，《青春有你3》被停播的原因是多方面的，包括选手的丑闻、粉丝的浪费行为、节目制作方的违规行为以及官方的责令。这些因素共同作用，最终导致了节目的停播。